GPU加速運算：Nvidia整合模擬與多種資料處理工具，Clara系列提供加速藥物研發的解決方案

由於全球各國正面臨武漢肺炎的侵襲，所有的人都在關切疫苗何時可以研發出來，是否有方法和技術能加速這個過程？

對此，Nvidia也在今年10月舉行的GTC大會上，首度展示了Ominiverse可支援藥物研發（Drug Discovery）需要的模擬影像渲染。

Nvidia創辦人暨執行長黃仁勳表示，我們可透過電腦運算模擬的方式，針對會影響疾病的蛋白質，理解其生物學的相關機制，並在漫長的體內試驗測試過程之前，能夠找到表現較為優異的候選藥物，因此，在部署藥物研發這類應用時，會需要搭配多種技術，像是基因組學（Genomics）、低溫電子顯微鏡成像與3D重建、資料分析、深度學習、對接（Docking）、病理學與放射學成像、自然語言處理。

對此，他們也宣布推出Clara Discovery，希望協助醫界更快找出拯救生命的藥物。這套軟體應用裡面，包含了哪些成員？黃仁勳表示，有些是常用工具，Nvidia的電腦科學家會設法提供加速處理的方法，當中也一些是他們近期新加入或新開發的工具，像是Clara Parabricks（Nvidia在2019年併購Parabricks）、Clara Imaging、BioMegatron、BioBERT、RAPIDS。

基本上，這套解決方案是用於運算型藥物研發處理的應用程式與框架集合，已針對Nvidia DGX整合應用設備進行最佳化調校，而能因應醫療領域最大型的運算型工作任務，並可結合影像學、放射學、基因組學的力量，以便開發AI應用程式。

目前的Clara Discovery有那些特色？Nvidia提供預先訓練過的AI模型與應用程式專屬的框架，協助研究人員定義下一代的藥物研發過程，包含：尋找標靶、組建化合物，以及培養藥物反應。

這裡也運用了自然語言處理技術，能讓研究人員經由生物醫學的特定語言模型，來組織、理解、啟動大型資料集、研究文獻，並且針對現有療法的論文與專利，以及其他重要真實世界資料，進行分類。